Magento在分类中可以修改产品的Position，数值越大的显示越靠后，批量把缺货的产品的Position修改大一些即可控制让他们靠后显示，给其他有货的产品让出宝贵的位置。

语句如下：

update catalog_category_product set position=position+50000 where product_id in (SELECT product_id FROM `cataloginventory_stock_status` where stock_status=0) and position<50000;

内部查询语句找出所有缺货的产品ID，外部查询语句更改其值增加50000，为了以后有货的时候把位置调回默认的数值，我们用position<50000作为条件，这样以后就可以用position<50000的减少50000更改回去。

这个思路来自

Magento中把缺货(OutOfStock)产品排序到后面显示